Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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FXNQ16595 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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