Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYPL1Q16563 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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