Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
GRIK5Q16478 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK5Q16478 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms