Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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TNXAQ16473 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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TNXAQ16473 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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TNXAQ16473 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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TNXAQ16473 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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TNXAQ16473 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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