Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GABRA6Q16445 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GABRA6Q16445 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GABRA6Q16445 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GABRA6Q16445 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GABRA6Q16445 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GABRA6Q16445 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GABRA6Q16445 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GABRA6Q16445 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
GABRA6Q16445 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GABRA6Q16445 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GABRA6Q16445 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms