Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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SSX1Q16384 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSX1Q16384 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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