Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZFHX3Q15911 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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