Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SCN9AQ15858 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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SCN9AQ15858 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SCN9AQ15858 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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SCN9AQ15858 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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SCN9AQ15858 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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