Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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USF2Q15853 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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USF2Q15853 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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USF2Q15853 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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USF2Q15853 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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USF2Q15853 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USF2Q15853 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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USF2Q15853 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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USF2Q15853 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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USF2Q15853 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USF2Q15853 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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