Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ATXN8Q156A1 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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ATXN8Q156A1 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATXN8Q156A1 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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