Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms