Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HMGN3Q15651 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HMGN3Q15651 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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