Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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SEC23BQ15437 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23BQ15437 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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