Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB3GAP1Q15042 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms