Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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