Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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UBE4AQ14139 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
UBE4AQ14139 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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UBE4AQ14139 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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UBE4AQ14139 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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UBE4AQ14139 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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UBE4AQ14139 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
UBE4AQ14139 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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