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| RUNX3 | Q13761 | AC117532.1-201 | ENST00000514638 | 323 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-150P-201 | ENST00000516237 | 95 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC060788.1-201 | ENST00000521318 | 469 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001646.3-201 | ENST00000526305 | 446 nt | TSL 2 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC091931.1-201 | ENST00000623488 | 728 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL445523.1-201 | ENST00000451184 | 1362 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC009511.1-201 | ENST00000543527 | 191 nt | TSL 5 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133279.1-201 | ENST00000553487 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC090409.2-202 | ENST00000585706 | 604 nt | TSL 5 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL035413.2-201 | ENST00000604801 | 525 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC064807.4-201 | ENST00000607201 | 407 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009090.3-201 | ENST00000616553 | 565 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLECL1-204 | ENST00000621400 | 611 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356266.1-201 | ENST00000623311 | 483 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CD44-239 | ENST00000639002 | 528 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099063.3-201 | ENST00000642066 | 185 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNMT-206 | ENST00000589866 | 1879 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF680-202 | ENST00000447137 | 2159 nt | TSL 2 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AFDN-AS1-202 | ENST00000417244 | 182 nt | TSL 2 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC019097.1-201 | ENST00000424783 | 735 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC063976.3-201 | ENST00000426849 | 329 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL590103.1-201 | ENST00000434488 | 307 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | TAF9P1-201 | ENST00000445421 | 515 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EPS15P1-201 | ENST00000448836 | 336 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445669.2-201 | ENST00000454425 | 421 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAF9P2-201 | ENST00000454958 | 515 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00894-208 | ENST00000455777 | 284 nt | TSL 2 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00492-201 | ENST00000504436 | 593 nt | TSL 3 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096577.1-203 | ENST00000506386 | 541 nt | TSL 3 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP005357.1-201 | ENST00000520749 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5M10-201 | ENST00000526812 | 1052 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FBXO3-210 | ENST00000532057 | 918 nt | TSL 2 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008114.1-201 | ENST00000544122 | 427 nt | TSL 2 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL160191.1-202 | ENST00000554008 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL450442.1-201 | ENST00000554042 | 854 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157938.2-201 | ENST00000587264 | 894 nt | TSL 5 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL669831.4-202 | ENST00000590817 | 238 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NRBF2P5-201 | ENST00000603087 | 788 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC080013.4-201 | ENST00000607624 | 649 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356596.1-201 | ENST00000624230 | 379 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC048347.1-201 | ENST00000624621 | 427 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA50A-202 | ENST00000629536 | 136 nt | BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF382-210 | ENST00000639288 | 834 nt | TSL 5 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |