Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IRF5Q13568 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms