Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms