Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MSLNQ13421 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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