Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms