Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CHAF1BQ13112 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms