Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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