Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158 ms