Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRZ1P23471 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRZ1P23471 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRZ1P23471 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRZ1P23471 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRZ1P23471 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
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PTPRZ1P23471 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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PTPRZ1P23471 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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PTPRZ1P23471 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
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PTPRZ1P23471 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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PTPRZ1P23471 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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PTPRZ1P23471 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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PTPRZ1P23471 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRZ1P23471 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
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