Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTPREP23469 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPREP23469 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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PTPREP23469 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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PTPREP23469 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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PTPREP23469 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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PTPREP23469 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPREP23469 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPREP23469 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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