Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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