Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms