Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PHACTR1Q9C0D0 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PHACTR1Q9C0D0 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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