Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SAMD8Q96LT4 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms