Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RPE65Q16518 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPE65Q16518 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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