Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CNN3Q15417 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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