Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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