Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SHPRHQ149N8 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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