Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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