Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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APOFQ13790 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
APOFQ13790 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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