Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NCOA4Q13772 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms