Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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PTCH1Q13635 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTCH1Q13635 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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