Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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