Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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FOXE3Q13461 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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