Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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TCOF1Q13428 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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TCOF1Q13428 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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TCOF1Q13428 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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TCOF1Q13428 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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TCOF1Q13428 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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TCOF1Q13428 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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TCOF1Q13428 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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TCOF1Q13428 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCOF1Q13428 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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