Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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