Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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GRIK3Q13003 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK3Q13003 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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