Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms