Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SOBPA7XYQ1 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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