Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms