Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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