Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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CNGA3Q16281 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
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CNGA3Q16281 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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CNGA3Q16281 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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CNGA3Q16281 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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CNGA3Q16281 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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CNGA3Q16281 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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