Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNHIT3Q15649 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNHIT3Q15649 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNHIT3Q15649 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms