Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TTF1Q15361 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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